一、稅務機關多收了稅款怎么辦？相關法律規定是什么？

專業分析
納稅人超過應納稅額繳納的稅款，稅務機關發現后應當立即退還;納稅人自結算繳納稅款之日起三年內發現的，可以向稅務機關要求退還多繳的稅款并加算銀行同期存款利息，稅務機關及時查實后應當立即退還;涉及從國庫中退庫的，依照法律、行政法規有關國庫管理的規定退還。
《中華人民共和國稅收征收管理法》第五十一條
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引用法規
[1]《中華人民共和國稅收征收管理法》 第五十一條

二、分公司如何繳稅，法律上是如何確定的

1、要看分公司是否屬于獨立核算，如果分公司不獨立核算，財務并入總公司統一核算管理，是否要建立有關輔助帳、明細帳，可由總公司確定。

2、分公司與總公司經營的業務相同，分公司實行報帳制度，在所屬地辦理相關證照。經總公司主管稅務機關同意后，分公司實行增值稅預征，然后由總公司統一抵扣。